|Luis Edgardo Figueroa Montes

Médico patólogo clínico.

Director de Medicina del Laboratorio

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Un interesante artículo publicado el 11 de septiembre por Eric Topol (médico cardiólogo, genetista e investigador), titulado «Genómica humana versus genómica clínica», menciona que han pasado más de 20 años desde que se secuenció el primer genoma humano; sin embargo, la enorme cantidad de datos que se ha generado no se han transformado en beneficio de la atención clínica del paciente, de forma rutinaria (1).

Menciona que, a la fecha, se ha secuenciado el genoma -conjunto completo de instrucciones del ácido desoxirribonucleico- a más de 30 millones de personas en el mundo, de diferentes países y continentes. Destacando que estos programas de investigación han generado muy poco uso de esta secuenciación de los genomas, para un impacto en la práctica clínica diaria en los pacientes (1).

El polimorfismo de un solo nucleótido evalúa alrededor de 1 millón de letras (todo el genoma tiene 3 mil millones de letras). Estos polimorfismos son considerados marcadores biológicos, ayudando a los científicos a localizar genes asociados con enfermedades. Se encuentran en más del 5% de la población y son el tipo de variación genética más común entre las personas (2).

Existen unas pruebas de array, que es una técnica utilizada en diagnóstico genético para analizar el genoma completo de un individuo en busca de alteraciones de material genético. Existen SNP-arrays y se pueden usar para determinar «puntajes de riesgo poligénico» para una amplia variedad de enfermedades importantes y comunes, como la enfermedad coronaria, la fibrilación auricular, el cáncer de mama, colon y próstata, diabetes mellitus tipo 2, enfermedad inflamatoria intestinal, entre otras (1).

En 2019, algunas revistas médicas de alto impacto hicieron algunas proyecciones sobre el papel de las puntuaciones de riesgo poligénico en la práctica clínica. Por ejemplo, JAMA, en este artículo menciona que la precisión predictiva de una puntuación de riesgo poligénico, puede ser un modelo de predicción para el riesgo clínico de enfermedad coronaria, donde concluye que el uso de la información genética en su modelo de predicción necesita una mayor investigación antes de la implementación en la práctica clínica (4).

Tener presente que todas las secuencias genéticas realizadas a una persona están almacenadas en 25 mil genes. Pero existen algunas poblaciones que tienen algunas variaciones genéticas (polimorfismo de un solo nucleótido – SNP), en algunos genes y estas variaciones están relacionadas a tener mayor susceptibilidad genética a la exposición de una enfermedad transmisible (tuberculosis, por ejemplo) o susceptibilidad a enfermedades no transmisibles (cáncer o diabetes, por ejemplo). En el caso de Latinoamérica, al existir pocos estudios de sus genomas tendríamos un subregistro de estas variaciones con las pruebas de array que se ofrecen. Por lo tanto, podríamos tener falsos negativos de variaciones genéticas en sus chips de sus array.

Otro tema crucial es el precio. Una secuencia completa -según el artículo- está en promedio (asumo en países de altos ingresos) entre 400 a 600 dólares y, en junio, una compañía (Ultima genomics) refiere que costaría $100, el mismo costo de una matriz SNP que proporciona con 99.9% menos datos (5, 6). Se anticipa que el costo de una secuenciación de alta precisión y del genoma completo se acercará a estos precios en los próximos dos años (1). En el Perú ofrecen este servicio algunas empresas, y los precios pueden oscilar entre $2000 a $2500, con diferentes valores agregados en el servicio; como la interpretación del informe y seguimiento ¿Cómo será en los otros países de la región?

El médico peruano Heinner Guio, investigador en el área de genética y genómica, menciona que la verdadera utilidad de estas nuevas pruebas será útil en poblaciones más estudiadas. En Latinoamérica y Perú tenemos escasos aportes en esta área. A la fecha existe una lenta transición de ser solo recolectores de muestras a ser analistas de muestras al 100%. Destacar que la expresión genética de nuestras poblaciones está relacionadas a su medio ambiente «Epigenética» y las variaciones genéticas moduladas que pueden presentar serán diferentes a otras poblaciones (europeas o asiáticas). Por ejemplo, en población de la Amazonia o que vive en la altura (varios metros sobre el nivel del mar) modularían esta expresión y deben ser materia de estudio e investigación (7).

Heinner Guio, en su artículo titulado «Genética y genómica en el Perú: perspectiva clínica e investigativa» aborda diferentes aspectos. Menciona que los servicios genéticos en el Perú son escasos pero crecientes, a pesar de las limitaciones en infraestructura y recursos humanos calificados. Destaca que son pocos los médicos genetistas acreditados por el Colegio Médico del Perú. Concluye que se está trabajando en genética y genómica a pesar de la falta de inversión nacional. Los proveedores de salud multidisciplinarios han venido contribuyendo al área de la genética. Existen diferentes logros en los campos clínico y de investigación. A medida que aumenten el número de profesionales bien capacitados, en casa y en el exterior -aportando con colaboradores nacionales e internacionales-, la investigación y las experiencias clínicas aumentarán en calidad y extensión. En estos tiempos, donde están surgiendo muchas tecnologías y datos estandarizados, la colaboración es muy importante para la investigación y su traducción al sistema de salud pública, ayudando en la implementación de la medicina de precisión (8). Por lo tanto, hay mucho por construir en este campo ¡No es tarde!

Enlaces de interés

1. https://erictopol.substack.com/p/human-genomics-vs-clinical-genomics?s=r&utm_campaign=post&utm_medium=web

2. https://medlineplus.gov/spanish/genetica/entender/investigaciongenomica/snp/

3. https://www.nature.com/articles/s41588-018-0183-z

4. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2761088

5. https://www.science.org/content/article/100-genome-new-dna-sequencers-could-be-game-changer-biology-medicine

6. https://www.ultimagenomics.com/

7. https://inbiomedic.com/exoma-clinico/

8. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/mgg3.533